[VIP第1年] 指数:3
**初是sanger法，江苏销售RNA合成仪价烙，后来发展了几种高通量测序方法1sanger法：双脱氧测序的原理，DNA合成时加上一个ddNTP从而终止这条链的延伸，毛细管电泳读取分析序列。一般教材讲的都是这种方法，经典，读长800bp，但是通量小成本高。2454：也称焦磷酸测序，一个run下来约400M的数据量。将emulsionPCR产物连磁珠上，放入PicoTiterPlate，测序反应是通过释放PPi经过ATP***化酶和荧光素酶作用发光D捕捉拍照，反应是连续的，所以遇到连续的碱基如polyA时，454易产生误差，江苏销售RNA合成仪价烙。3Solexa：边合成边测序，将DNA单链固定在芯片上，江苏销售RNA合成仪价烙，合成DNA簇，是一种可逆阻断的合成反应，每个循环只加上一个碱基、系统拍照一次。通过读取拍照信号分析序列，一个run约200个G数据量以上。目前能量比较高，不足是读长短，现在有PE150，可以测通300bp。4Soild：与454有相似之处，该方法更精细，磁珠富集，磁珠更小，密度更高。它的独特之处是连接反应测序，加入8碱基荧光单链混合物。一次测序读两个碱基，获得颜色编码组成的碱基序列，通过几轮反应**终得出序列。5Iontorrent：特点是小巧。试剂通过集成的流体通路进入芯片中，密布于芯片上的反应孔立即成为上百万个微反应体系。
DNA和RNA提取方法一、DNA的提取(方法一)1.实验试剂(1)DNA提取液:Tris HCl(pH),NaCl,EDTA,1％SDS(2)3MNaAc(3)TE:10mmol/LTris-HClmmol/LEDTA(4)酚():氯仿:异戊醇(25:24:1)(5)氯仿:异戊醇(24:1)(6)异丙醇(7)无水乙醇(8)75%乙醇(9)RNaseA2.实验步骤(1)取菌丝,在液氮中迅速研磨成粉(2)加入4mL提取液,快速振荡混匀(3)加入等体积的4mL的氯仿:异戊醇(24:1),涡旋3～5min(此处是粗提没有加酚,可以节约成本)(4)1000rpm,4℃,5min(5)上清用氯仿:异戊醇(24:1)再抽提一次(10,000rpm,4℃离心5min)(6)取上清,加入2/3倍体积的-20℃预冷异丙醇或,混匀,静置约30min(7)用毛细玻棒挑出絮状沉淀,用75%乙醇反复漂洗数次,再用无水乙醇漂洗1次,吹干,重悬于500ulTE中(8)加入1ulRNaseA(10mg/mL),37℃处理1h(9)用酚():氯仿:异戊醇(25:24:1)和氯仿:异戊醇(24:1)各抽提1次(10,000rpm,4℃离心5min)(10)取上清,1/10V3MNaAc,℃沉淀30min以上(11)沉淀用75%乙醇漂洗,风干,溶于200ulTE中,-20℃保存备用二、DNA的提取(方法二)1.菌丝2.加入3mL65℃预热的DNA提取缓冲液,快速振荡混匀65℃水浴30min,期间混匀2-3次3.加入1mL5MKAc,冰浴20min4.氯仿:异戊醇(24:1)抽提1次(10,000rpm,4℃离心5min)5.取上清。
用于和DNA或RNA结构类似的寡核苷酸合成的自动化仪器，即是DNA合成仪。通常用于固相合成法，每次在长的寡核苷酸链上接入一个核苷酸。加入每一个核苷酸均通过相同的化学反应和相应的嘌呤或嘧啶碱基衍生物作用。仪器不同，所用化学反应和操作细节也会随之发生变化。DNA合成的磷酸酰胺法得到了非常***的应用。发展高效率、高产率的仪器的开发与研究、应用领域的开拓和机器性能的完善为当前DNA合成仪的主要生产厂商的致力方向。全世界di一台高密度复制DNA合成仪已经为中国台湾科学**会“基因医药卫生科技前列研究计划”中的基因生物技术组成功研发出来，每天能够对768条DNA进行合成，能够同时对384条不同DNA进行合成。并且能够和聚合酶连锁反应装置相配合，对各种基因大量复制，除了对时间进行节省外，还能够对大量人力进行节省。这部机器能够将防伪基因、动物、人体、植物的基因甚都复制出来。因为目前DNA合成仪可以合成的**长核酸链的碱基对数量对于人们所需要的大部分核酸的碱基对数量来说还远远不够，所以，还需要对合成工艺不断地进行改善，才能够使较长的核酸分子得到。不断涌现出按照不同化学方法研制的DNA合成仪，可以将现有核酸合成的碱基对数量限制突破。
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